Moment de joie pour Sissi et Franz avec l'arrivée d'un héritier pour le trône. Mais ce bonheur est menacé par des luttes de pouvoir en Europe. Bismarck menace d'entraîner l'Autriche dans une nouvelle guerre et Sissi est reléguée en coulisses. La jeune femme se rend pourtant en Hongrie pour une mission politique tout en luttant contre l'attirance qu'elle ressent pour le comte Andrassy. Ils vont être tous les deux placés en captivité. Dans cette nouvelle saison, le coeur de Sissi s'emballe entre jeux de cour et sentiments exacerbés. La jeune impératrice va vivre de nouvelles aventures extraordinaires et façonner un peu plus son destin hors du commun.